云南大学现代生物学研究中心 作品数:36 被引量:139 H指数:6 相关作者: 张闻 张晓林 更多>> 相关机构: 中国科学院昆明动物研究所 云南师范大学化学化工学院 广东药学院药物研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 云南省应用基础研究基金 中国科学院知识创新工程 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 农业科学 文化科学 更多>>
P53蛋白质N末端的二级结构预测及其三维构象 被引量:3 1998年 以编码P53N末端120个残基的mRNA二级结构为基础,结合Chou-Fasman蛋白质二级结构预测原则,预测出P53蛋白质N端的93个残基包含四段α螺旋结构(14-26;38-46;51-56;68-70),没有发现β片层。与四种以多重序列联配为基础的蛋白质二级结构预测方法(准确率均为73.20%左右)相对照,结果十分相近。在SGI工作站上以此为初始结构建立的三维构象提示,P53N末端前80个氨基酸肽段呈弧型板块结构,其转录激活区由两段主要螺旋组成,呈上下构形,占据弧型板块的顶部及底部外侧缘。C端13个富含脯氨酸肽段则呈弯曲松散状。 张彦 刘次全关键词:P53蛋白质 MRNA二级结构 用生物信息学方法对尖吻蝮蛇蛇毒金属蛋白酶cDNA序列进行抗原位点分析 【目的意义】据世界卫生组织网站最新公布的数字显示:全世界约有3000多种蛇,600余种是有毒蛇;每年被蛇咬伤的人数有250万人,导致死亡人数高达12.5万人。我国现有蛇类200多种,其中有毒蛇50余种,主要分布在长江以南... 张志晓 杨彦 叶锋平 范泉水 李东江 张希 符云新 郑颖关键词:抗原位点 生物信息学方法 尖吻蝮蛇蛇毒 金属蛋白酶 文献传递 三种分子生物学数据库的格式和使用 被引量:1 1998年 本文介绍三大分子生物学数据库——蛋白质及生物分子三维结构数据库PDB、瑞士蛋白质序列及注解数据库SWISS-PROT和国际核酸序列数据库EMBL/GenBank/DDBJ的发展情况,以及从Internet检索和调用其数据记录方法,列表给出了三大数据库的记录格式和标题调整含义,并简介了Internet上其他生物学数据库的发展情况和调用方法. 张闻 刘世熙 曹槐关键词:PDB 数据库 INTERNET DISTRIBUTIONS OF TRIPLET CODONS IN MESSENGER RNA SECONDARY STRUCTURES 被引量:1 1998年 Analysis of the secondary structures of mRNAs which encode mature peptides shows that the location of each codon in mRNA secondary structure has a trend, which appears to be in agreement with the conformational property of the corresponding amino acid to some extent. Most of the codons that encode hydrophobic amino acids are located in stable stem regions of mRNA secondary structures, and vice versa, most of the codons that encode hydrophilic amino acids are located in flexible loop regions. This result supports the recent conclusion that there may be the information transfer between the three dimensional structures of mRNA and the encoded protein. 张静 顾宝洪 彭守礼 彭守礼Cu^(2+)与胆固醇相互作用的光谱分析研究 1998年 以分光光度法(SA)、原子吸收光谱分析(AAS)、电感耦合等离子体原子发射光谱法(ICP-AES)以及红外光谱分析(IR)考察了水溶液中Cu2+与胆固醇的相互作用。不同分析方法均得出相同结果,Cu2+与胆固醇二者间存在表面吸附作用。 宋仲容 曹槐 刘世熙关键词:胆固醇 相互作用 光谱分析 铜离子 烤烟烟叶中几种化学元素对评吸质量的影响 用相关分析和逐步回归分析法,讨论了经不同施肥处理连续两年种植、采烤的烤烟烟叶中部分无机化学元素、有机成分及评吸指标间的相互关系,提出了通过监测生长期间烟叶中钙和硝态氮含量来提高烟叶内在品质的可能性。 曹槐 潘蓄林 宋仲容关键词:烤烟 化学元素 评吸质量 文献传递 内含子序列“三碱基组”的信息分析 被引量:7 1997年 在对编码序列的碱基分布作大量统计分析的基础上,对内含子序列中G、C的分布作了统计分析.发现内含子在“三碱基组”的意义下,第一位上(G+C)含量占优势.如果将同一基因的外显子三联密码和内含子“三碱基组”做比较,发现在内含子中出现而外显子中没有的那些三碱基组,它们大多属于Lió所列出的“非偏爱” 张静 杨自天 刘次全关键词:内含子 DNA RNA折叠 被引量:1 2004年 与蛋白质相比 ,RNA的折叠是一个比较新的研究领域 .不同的RNA分子可能沿着不同的路径 ,以某些与蛋白质折叠并不完全相同的方式构建出复杂的三维结构 .在此过程中 ,RNA要受到许多环境因素的影响 .对这些因素以及RNA的折叠机制进行深入的分析 ,将加深人们对地位显得日益重要的RNA分子的结构与功能的理解 。 王传铭 潘珉 曹槐关键词:RNA分子 蛋白质折叠 基因表达调控 环境因素 mRNA解折叠的链构象与相应新生肽链构象相关性的探索 被引量:3 2006年 在蛋白质翻译过程中,mRNA发夹依次解折叠成具有特定构象的单链,后者在核糖体上通过与A和P位点tRNA相互识别、取向和定位等,影响或决定肽基转移中心的新生肽链的构象。翻译过程是复杂的,但其机理可能是简单的。 刘次全关键词:MRNA 新生肽链 核酸四碱基体的量子化学计算 被引量:1 1998年 应用量子化学半经验CNDOMO方法,对核酸碱基间可能形成的四碱基体进行计算.结果显示,除了实验中已确认存在的两种四碱基体G4和G·C·G·C外,还有6种以Watson-Crick碱基对形成的四碱基体也能稳定存在.通过对G4碱基体分子间、离子-分子间相互作用的考查,进一步证实了氢键、四碱基体间的堆积作用、金属离子与四碱基体的相互作用等,对于四螺旋核酸结构的形成是重要的. 曹槐 谢小光 刘世熙关键词:核酸 量子化学计算