杭州华大基因研发中心
- 作品数:90 被引量:129H指数:6
- 相关机构:浙江大学绍兴市妇幼保健院浙江省台州医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金绍兴市科技计划项目浙江省医药卫生科学研究基金更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学生物学更多>>
- 起译密码子AUG侧翼序列对水稻基因表达水平的影响被引量:1
- 2004年
- 对541条水稻基因序列测定了其起译密码子AUG侧翼区序列(-20~+6)不同位点的同义密码子偏性及基因表达水平。结果表明,与密码子适应指数(CAI)和密码子偏好指数(CPP)、mRNA丰度呈显著或极显著相关的位点分别有5个(-19、-18、-9、-4和+5)、8个(-19、-18、-14、-9、-6、-4、-1和+5)和7个(-18、-16、-15、-9、-7、-1和+6),其中只有-4和+5位点与CAI和CPP的值正相关,表明上述位点在转录水平上处于有利进化的自然选择压。对高表达的变应原蛋白基因7个特殊位点(-18、-16、-15、-9、-7、-1和+6)的碱基作定点突变分子模拟,其表达量分别降低63.3%和72.5%,显示了这些位点对基因表达的重要性。AUG侧翼序列适应指数(AUGCAI)与侧翼区的G+C含量呈高度正相关(r=0.625),表明在AUG侧翼富集G+C对翻译起始更有效。紧邻起译密码子AUG侧翼序列8个位点(-6~-1和+4~+6,除-4外)对G或C强烈偏好,暗示这是调节翻译起始效率以及同义密码子偏性的重要因素之一,尤其是在高表达基因中。
- 刘庆坡谭军薛庆中
- 关键词:水稻起译密码子基因表达
- 耐高温HSP70分子伴侣基因及其编码的多肽和制备方法
- 本发明涉及编码具有活性或其功能等同变异体的分离的DNA和利用重组DNA技术以所述分离的DNA生产具有耐高温HSP70分子伴侣活性的多肽或其功能等同变异体。以腾冲嗜热厌氧菌全基因组测序与分析为基础,克隆分离了耐高温HSP7...
- 于军李蔚李杰胡松年田宇清
- 文献传递
- 耐高温胞嘧啶脱氨酶基因及其编码的多肽和制备方法
- 本发明公开了一种耐高温胞嘧啶脱氨酶基因序列及编码的多肽和制备方法。它涉及编码具有活性或其功能等同变异体的分离的DNA和利用重组DNA技术以所述分离的DNA生产具有耐高温胞嘧啶脱氨酶活性的多肽或其功能等同变异体发明。以腾冲...
- 包其郁杨焕明林霞胡松年李蔚
- 文献传递
- 耐高温二氢乳清酸脱氢酶基因序列及编码的多肽和制备方法
- 本发明公开了一种耐高温二氢乳清酸脱氢酶基因序列及编码的多肽和制备方法。它涉及编码具有活性或其功能等同变异体的分离的DNA和利用重组DNA技术以所述分离的DNA生产具有耐高温二氢乳清酸脱氢酶活性的多肽或其功能等同变异体。以...
- 于军李蔚林霞胡松年田宇清
- 文献传递
- 检测SARS冠状病毒抗体的方法及其试剂盒
- 本发明提供了公开了一种检测SARS冠状病毒抗体的方法及其试剂盒。具体检测步骤如下:(1)利用纯化的全病毒裂解液包被一种固相支持物;(2)将待检测的生物学样本加入经包被的固相支持物上,在适合形成抗原抗体免疫结合复合物的条件...
- 汪建祝庆余方健秋秦鄂德文洁于曼牟峰司炳银陈唯军刘斯奇胡咏武殷剑宁王俊杨焕明
- 文献传递
- 耐高温苏氨酸合成酶基因及其编码的多肽和制备方法
- 本发明涉及编码具有活性或其功能等同变异体的分离的DNA和利用重组DNA技术以所述分离的DNA生产具有耐高温苏氨酸合成酶活性的多肽或其功能等同变异体。以腾冲嗜热厌氧菌全基因组测序与分析为基础,克隆分离了耐高温苏氨酸合成酶基...
- 包其郁杨焕明卢小羽胡松年刘斯奇
- 文献传递
- 耐高温尿苷激酶基因及其编码的多肽和制备方法
- 本发明公开了一种耐高温尿苷激酶基因及其编码的多肽和制备方法。它涉及编码具有活性或其功能等同变异体的分离的DNA和利用重组DNA技术以所述分离的DNA生产具有耐高温尿苷激酶活性的多肽或其功能等同变异体。以腾冲嗜热厌氧菌全基...
- 李松岗王俊张立敏汪建杨焕明
- 文献传递
- 耐高温二氢乳清酸合酶基因及其编码的多肽和制备方法
- 本发明公开了一种耐高温二氢乳清酸合酶基因及其编码的多肽和制备方法。它涉及编码具有耐高温二氢乳清酸合酶活性或其功能等同变异体的分离的DNA及利用重组DNA技术以所述分离的DNA生产具有耐高温二氢乳清酸合酶活性的多肽或其功能...
- 董伟杨焕明卢小羽胡松年张小英
- 文献传递
- 检测非典型性肺炎病毒的方法及其试剂盒
- 本发明公开了一种临床检测非典型性肺炎病毒的方法及其试剂盒。根据非典型性肺炎病毒基因组序列的特征分析,选取特异性的区域,又根据该病毒是核糖核酸病毒的特点,利用特定的引物序列,采用RT-PCR和PCR相关的试剂与技术,建立了...
- 汪建王俊李蔚徐祖元林伟胡咏武张晓伟邓亚军杨唤明
- 文献传递
- 2725名新生儿耳聋基因热点突变的筛查分析被引量:9
- 2015年
- 目的 通过调查浙江省绍兴地区2725名新生儿中常见耳聋基因GJB2、GJB3、线粒体12SrRNA和SLC26A4的20个热点突变的携带率、突变类型及其与听力的相关性,为大规模开展聋病基因筛查提供科学依据.方法 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(matrix-assisted laser desorptionionization-time of flight-mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)进行热点突变检测.结果 2725名新生儿中共检测出突变149例,阳性率5.47%:其中GJB2突变84例,阳性率3.08%;GJB3突变13例,阳性率0.48%;SLC26A4突变49例,阳性率1.80%;线粒体12SrRNA突变3例,阳性率0.11%.检出突变位点共14个,突变频率由高到低依次是GJB2 c.235delC 65例、SLC26A4 IVS7-2A>G 34例、GJB2c.299-300delAT 13例、GJB3 c.538C>T 7例、GJB2 c.176_191del16 6例和GJB3 c.547G>A 6例.结论 常见耳聋基因在绍兴地区新生儿中有较高的阳性率,扩大筛查位点可提高筛查阳性率和突变位点的检出率.除GJB2、线粒体12S rRNA和SLC26A4外,本地区GJB3突变亦有较高的检出率,可能在耳聋发生中起重要作用.
- 余红刘丹杨晶群吴志强孙冬梅马卧龙
- 关键词:耳聋基因突变位点