国家自然科学基金(31071166)
- 作品数：16 被引量：54H指数：3
- 相关作者：饶绍奇梁岩林美华赵小蕾左晓宇更多>>
- 相关机构：广东医学院茂名市人民医院中山大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- 基于知识学习的冠心病风险功能模块挖掘方法研究
- 2013年
- 目的发展基于先验知识策略挖掘冠心病风险功能模块的网络分析方法。方法通过蛋白－蛋白互作知识引导扩展冠心病风险基因，构建冠心病特异性基因网络。应用Newman谱算法分解网络获取其中的高度模块化的网络模块（子网），并对各模块进行网络拓扑性质评价和功能富集分析。结果应用266个冠心病易感基因作为种子基因，由蛋白－蛋白互作知识引导构建了冠心病特异性网络，其中包含1819个基因和9767个互作对。应用谱分解法提取了14个模块，其中多数符合无标度网络特性。功能富集分析发现这些模块参与系列已知的冠心病风险生物学通路以及一些新的冠心病风险通路。结论应用表明本文提出的知识学习方法是一种识别复杂疾病风险功能模块的有效方法。
- 李豪丽左晓宇欧阳平林美华赵忠梁岩钟寿强饶绍奇
- 关键词：数据挖掘冠心病
- 脂肪细胞因子基因多态性与T2DM关联性Meta分析被引量：5
- 2013年
- 目的 应用Meta分析对脂肪细胞因子中的肿瘤坏死因子α、瘦素受体和脂联素基因多态性与2型糖尿病（T2DM）关联性进行综合评价。方法 应用哈代-温伯格平衡对入选文献的基因型进行遗传平衡性检验,根据异质性检验结果选用固定或随机效应模型,采用Begg＇s和Egger＇s法对发表偏倚进行量化检测,应用RevMan 5.1软件进行Meta分析。结果 共50篇文献符合条件纳入研究,纳入文献无明显发表偏倚;瘦素受体 SNP-668A〉G与T2DM的关联性差异无统计学意义;而肿瘤坏死因子α SNP-308G〉A A对G等位基因的OR（95%CI）=1.38（1.11-1.71）,GA＋AA对GG基因型的OR（95%CI）=1.26（1.05-1.51）,差异均有统计学意义（P〈0.05）;脂联素SNP＋45T〉G G对T等位基因的OR（95%CI）=1.17（1.03-1.33）,GG＋TG对TT基因型的OR（95%CI）=1.16（1.01-1.34）,差异均有统计学意义（P〈0.05）。结论 瘦素受体SNP-668A〉G基因多态性与T2DM无明显关联,而肿瘤坏死因子α SNP-308G〉A和脂联素SNP＋45T〉G可能是T2DM的危险因素。
- 刘正辉孔丹莉修良昌饶绍奇丁元林
- 关键词：脂肪细胞因子多态性META分析
- 肿瘤坏死因子单核苷酸多态性与广东人群冠心病的关联分析被引量：2
- 2015年
- 目的 探讨肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor-α,TNF-α）G-308A和T-1031C单核苷酸多态性与广东地区汉族人群冠心病遗传易感性的关系。方法 应用SNPscan TM多重SNP分型试剂盒对广东地区汉族人群783例冠心病患者和749例正常对照样本DNA的2个SNP（G-308A和T-1031C）进行分型。应用卡方检验和Logistic回归模型进行统计分析。结果 TNF-αG-308A和T-1031C等位基因和基因型的频数分布在冠心病组和对照组间差异无统计学意义（P〉0.05）;多因素Logistic回归模型检验发现,校正混淆因素（年龄、性别、高血压、糖尿病、吸烟史）后,TNF-αT-1031C位点基因型在隐性模型下对冠心病有显著影响（P=0.045,OR=2.10,95%CI：1.02~4.33）,TNF-αG-308A和T-1031C位点的-308G/-1031T单体型对冠心病有显著影响（P=0.029）。但经max（T）permutation多重检验校正后,TNF-α基因型和单体型结果均不再显著（校正后P值分别为0.073和0.069）。结论 本研究尚未证实TNF-αG-308A和T-1031C位点多态性与广东地区汉族人群冠心病有关联性。
- 赵小蕾林美华范安欧阳平覃继恒修良昌饶绍奇
- 关键词：肿瘤坏死因子冠心病单核苷酸多态遗传易感性
- miRNA在冠心病中的作用机制
- 2015年
- MicroRNA（miRNA）是一类新发现的非编码小RNA分子。近来研究表明，miRNA在冠心病的发病机制中都起到了重要的调控作用，有望成为新型的特异性心肌损伤标记物及药物治疗的新靶点。本文系统性总结了近年来miRNA在冠心病领域的相关研究成果，并对其在临床中的应用价值进行了探讨。
- 韩克栋饶绍奇梁岩
- 关键词：MIRNA冠心病生物标记物药物靶点
- 2型糖尿病的遗传流行病学研究进展被引量：3
- 2011年
- 2型糖尿病是由于胰岛素抵抗或胰岛素分泌相对不足而导致慢性高血糖的多基因遗传病。该文总结了2型糖尿病的遗传模式，针对候选基因和连锁定位的研究，对近些年关注较多的2型糖尿病的易感基因进行分析，对其遗传流行病学的发展进行探讨。
- 祁素芬饶绍奇丁元林
- 关键词：2型糖尿病易感基因遗传流行病学
- 基于分治法的海量生物数据处理的研究与应用被引量：1
- 2014年
- 海量生物数据的不断涌现,在数据处理方面所面临的诸多问题亟待解决,例如在算法设计上会存在内存读写溢出和算法效率低下等问题;本文提出了一种基于分治法进行海量生物数据处理的方法。首先对计算机可用的内存资源进行评估,并对处理数据过程中产生的内存读写开销进行计算,进而与面向对象设计相结合,基于分治法对存储于mysql中的WTCCC数据库数据进行分块,最终将数据处理成可以被Plink软件识别的标准数据。
- 覃继恒赵小蕾左晓宇林美华栾奕昭饶绍奇
- 关键词：生物数据分治法面向对象设计数据库数据内存资源
- 中国人群ApoB XbaI基因位点多态性与冠心病关联性的Meta分析被引量：2
- 2015年
- 目的应用Meta分析探讨中国人群载脂蛋白B（apolipoprotein，ApoB）Xbal基因位点多态性与冠心病易感性的关联。方法应用哈代．温伯格遗传平衡检验对人选文献的基因型进行遗传平衡性检验，根据异质性检验结果选用固定或随机效应模型，采用Begg’s秩相关法和Egger’s线性回归法对发表偏倚进行量化检测，应用Stata 12．0软件进行Meta分析。结果共16篇文献符合条件纳入研究，纳入文献存在发表偏倚，但稳健性和敏感性分析显示其不影响Meta分析结果的稳定性和可靠性。以等位基因X^-为参照，X^＋的合并统计量OR（95％CI）为1．81（1．30，2．51）差异有统计学意义（P=0．018）；以基因型X^-X^-为参照，X^＋X^＋＋X^＋X^-基因型的合并统计量OR（95％CI）为1．76（1．26，2．44），差异有统计学意义（P=0．037）。结论在中国人群中，ApoB XbaI基因位点是冠心病的一个重要的易感位点。
- 陈业达林美华谭艺青赵翔饶绍奇
- 关键词：冠心病载脂蛋白B多态性META分析
- 瘦素及瘦素受体基因多态性与中国南方汉族人群冠心病的关联研究被引量：3
- 2016年
- 目的探讨瘦素基因rs2167270、rs4731426和瘦素受体基因rs12405556单核苷酸多态性与中国南方汉族人群冠心病（Coronary Artery Disease,CAD）的遗传易感性的关系。方法应用SNPscan TM多重SNP分型试剂盒对中国南方汉族人的1 044例冠心病患者和1 349例健康对照样本进行SNP分型;等位基因关联分析采用卡方检验;基因型关联分析采用单因素和多因素非条件Logistic回归分析方法。结果等位基因和基因型关联分析未发现rs2167270、rs4731426和rs12405556与冠心病有关联（P=0.242～0.978）;进一步按性别、是否患高血压、是否患2型糖尿病这3个混淆因素分层后,仍未发现3个SNP在各亚组与冠心病有关联（P=0.0938～0.997）。此外,也未发现这3个SNP与冠心病合并高血压/2型糖尿病存在显著关联（P=0.258～0.994）。结论本研究未发现瘦素基因rs2167270、rs4731426及瘦素受体基因rs12405556单核苷酸多态性与中国南方汉族人群的冠心病有关联。
- 谭艺青赵小蕾陈业达金律林美华张乃尊梁岩饶绍奇
- 关键词：瘦素基因瘦素受体基因冠心病遗传易感性
- BNP或NT-proBNP对冠心病的临床意义被引量：23
- 2017年
- 冠心病是最常见的心血管疾病,其发病率、死亡率一直居高不下,甚至有人预测到2020年冠心病将成为全球人口最主要的死亡病因。因此早期识别、诊断冠心病,并及时干预、治疗以阻止冠心病进一步发展显得尤为重要。关于BNP或NT-proBNP与冠心病(CHD)的关系,不少人进行了研究,表明BNP或NT-proBNP能反映冠心病的危重程度,并有助于冠心病的诊断及预后判断。
- 李立健饶绍奇田镭钢梁岩
- 关键词：BNPNT-PROBNP冠心病
- DNA甲基化与冠心病被引量：3
- 2015年
- DNA甲基化是一种发生在DNA序列上的甲基化修饰,可以在转录及细胞分裂前后稳定地遗传.近年来研究发现,DNA甲基化能够受到环境因素的影响,而且DNA甲基化又与冠心病发生发展过程有关.本文就DNA甲基化与冠心病生物标记物的关系,DNA甲基化与冠心病主要病因（动脉粥样硬化）的关系以及DNA甲基化与冠心病致病基因的关系进行了系统的综述分析,并讨论了目前冠心病表观遗传学研究存在的问题,最后探讨了进一步的研究方向.
- 赵翔金律栾奕昭饶绍奇
- 关键词：DNA甲基化冠心病生物标记物动脉粥样硬化
