海南省重点科技项目(90107)
- 作品数：15 被引量：64H指数：5
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- 相关机构：中国热带农业科学院海南大学更多>>
- 发文基金：海南省重点科技项目中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项项目海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 橡胶树AtCAB1同源基因的克隆及其在稳定与衰老期叶片中的差异分析被引量：15
- 2013年
- 以一编码蛋白与拟南芥的CAB1高度相似的EST序列作为探针,通过同源搜索从橡胶树的转录组数据中电子克隆到一条长1 415 bp的cDNA,该序列包含一798 bp的ORF及47 bp的5′UTR和570 bp的3′UTR,命名为HbCAB1;在此基础上,采用PCR技术成功扩增了包括该ORF在内的915 bp的cDNA序列。序列分析表明,该基因预测编码265个氨基酸,理论分子量为28.15 ku,等电点为5.25;蛋白含有1个保守的捕光叶绿素a/b结合蛋白结构域,3个跨膜螺旋和1个C端螺旋,1个三聚化基序,以及多个叶绿素和类胡萝卜素结合位点;蛋白与蓖麻(Ricinus communis)、杨树(Populus trichocarpa)、橄榄(Canarium album)中同源蛋白的相似性都在95%以上,显示出基因进化的保守性。半定量RT-PCR分析显示,与稳定期叶片相比,HbCAB1在衰老期叶片中的转录水平显著下调。
- 邹智杨礼富安峰王真辉袁坤庄美露
- 关键词：巴西橡胶树
- iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术鉴定健康和死皮橡胶树胶乳差异表达蛋白被引量：3
- 2014年
- 橡胶树死皮(Tapping panel dryness,TPD)是限制天然橡胶产量提高的关键因子之一,鉴定健康和死皮橡胶树胶乳差异表达蛋白对阐明橡胶树死皮发生机制具有重要意义。研究首次采用同位素标记相对和绝对定量(Isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)结合二维液相色谱串联质谱(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,2D LC-MS/MS)技术对健康和死皮橡胶树胶乳蛋白质组的差异进行研究。结果显示,有16个蛋白差异表达,其中,在死皮树中表达上调的蛋白有2个,下调的蛋白有14个。进一步应用实时荧光定量RT-PCR对其中6个差异蛋白的基因进行表达分析,发现其表达趋势与蛋白质组水平的研究结果一致。功能分析显示,这些差异蛋白主要与细胞程序性死亡(如TCTP、HSP70、CaM、cysteine protease等)和橡胶生物合成(如SRPP和diphosphomevelonate decarboxylase)相关,从蛋白质组学角度进一步验证了橡胶树死皮发生过程中涉及细胞程序性死亡和橡胶生物合成途径。
- 袁坤王真辉周雪梅邹智杨礼富
- 关键词：橡胶树死皮ITRAQMS细胞程序性死亡
- 橡胶树胶乳死皮相关蛋白的鉴定及分析被引量：8
- 2012年
- 橡胶树死皮(tapping panel dryness,TPD)是一种复杂的生理综合症,严重制约了天然橡胶产量的提高。为了分离鉴定橡胶树胶乳中与死皮发生密切相关的蛋白,采用双向电泳技术(2-DE)比较了其健康树和死皮树胶乳蛋白质组的差异。结果显示,在健康树和死皮树蛋白图谱上分别检测到1 158±25和1 173±30个蛋白点,其中54个蛋白点差异表达。经基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析和数据库检索后,成功鉴定16个蛋白,这些蛋白中的3-磷酸甘油醛脱氢酶、紫色酸性磷酸酶、动力相关蛋白、烯醇酶以及小橡胶粒子蛋白等可能在死皮发生过程中具有关键作用。为从分子水平上阐明橡胶树死皮发生机制提供了一定的理论依据。
- 袁坤徐智娟王真辉杨礼富
- 关键词：橡胶树死皮双向电泳蛋白质组
- 蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析
- 2012年
- 基于已公布的蓖麻基因组序列,利用电子克隆技术纠正了拼接错误的WRKY基因序列,获得蓖麻WRKY14基因信息。结果表明:该基因含有3个内含子,编码318个氨基酸的多肽,理论相对分子质量为35.49×103,等电点为8.64,总平均亲水性为-0.803,不稳定系数为46.88,核定位,属于不稳定的亲水性核定位蛋白;该蛋白含有1个WRKY结构域,其基序为WRKYGQK_X13_C_X5_C_X23_H_X1_H,保守内含子位于199位的K和200位的V之间,可归为Ⅱ大类a亚类;RcWRKY14的启动子区含有多种激素和胁迫应答相关元件RcWRKY14在叶片、花、胚乳和种子中都有表达,其中在花中的表达量最高,种子和叶片中次之,胚乳中最低。
- 黄启星郭安平杨礼富邹智
- 关键词：蓖麻WRKY转录因子电子克隆生物信息学分析
- 大戟科植物MVK基因家族的全基因组鉴定与分析被引量：1
- 2013年
- 基于已公布的基因组和EST数据,对蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树4种大戟科植物的MVK基因家族进行系统鉴定,并在此基础上分析其基因结构与进化关系。结果表明,这4种植物均含有2个MVK基因,所有基因均含有4个内含子。同源分析表明,MVK广泛存在于各种古细菌、真细菌和真核生物中,显示出较早的起源;虽然MVK在大多数基因组已测序的物种中主要以单拷贝的形式存在,但在所研究的4种大戟科植物中均出现了基因加倍现象,这与玉米和杨树类似。基因表达谱分析显示,在蓖麻的叶片、花、II/III期胚乳、V/VI期胚乳和种子等组织中,RcMVK1的表达丰度总体高于RcMVK2;虽然2个基因表达丰度最高的组织均为II/III期胚乳,但丰度最低的组织却分别为种子和叶片。
- 邹智杨礼富安锋王真辉袁坤
- 关键词：全基因组
- 橡胶树胶乳黄色体死皮相关蛋白的鉴定及分析被引量：4
- 2012年
- 本实验通过双向凝胶电泳技术(2-DE)比较橡胶死皮树与健康树胶乳黄色体蛋白表达谱的差异,通过软件分析比较获得37个差异表达的蛋白点,经基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分析后,搜索NCBInr数据库,结果表明,有11个蛋白点被成功鉴定,其中7个为未知蛋白,其余4个蛋白分别为chloroplast 23 kDa polypeptide of photosystem II、ATP synthase beta chain、NADP-dependent sorbitol-6-phosphate dehydrogenase和vitamin-b12 independent methionine synthase。这4个蛋白在死皮树中表达量均下调,可能在死皮发生过程中起着重要作用。本研究将为进一步阐明橡胶树死皮发生的分子机制提供理论依据。
- 周雪梅杨礼富王真辉邹智袁坤
- 关键词：橡胶树死皮双向凝胶电泳蛋白
- 橡胶树胶乳全蛋白的提取及双向电泳分析被引量：2
- 2010年
- 以橡胶树无性系RRIM600为材料,采用TCA(三氯乙酸)-丙酮沉淀法提取胶乳全蛋白,17cmpH5～8固相pH梯度预制干胶条和快速银染法对提取的蛋白进行分离和染色,所得到的电泳图谱背景清晰,横条纹和竖条纹少,且蛋白点数量多。通过本研究获得了高分辨率的胶乳全蛋白双向电泳(2-DE)图谱的方法,为进一步开展橡胶树胶乳全蛋白质组学研究奠定了基础。
- 徐智娟袁坤丁璇杨礼富
- 关键词：橡胶树胶乳双向电泳
- 4种大戟科植物Lhca基因家族的全基因组鉴定、分类与进化分析被引量：4
- 2014年
- LHCI是植物光系统I（PSI）中与色素分子结合的一系列膜蛋白，由Lhca基因家族编码，主要参与光能的捕获与传递。虽然Lhca基因家族已在拟南芥、水稻、杨树等模式植物中得到了系统鉴定，但在以高光效和高生物量著称的大戟科植物中，至今还未见Lhca类基因的报道。研究基于蓖麻、麻风树、木薯和橡胶树等4种大戟科植物已公布的基因组和EST数据对Lhca基因家族进行全面鉴定，并分析了其基因结构、生化特性及进化关系。结果表明，蓖麻、麻风树、木薯和橡胶树分别含有6、6、9和9个Lhca基因，分属于Lhca1、Lhca2、Lhca3、Lhca4、Lhca5和Lhca6等6个亚家族，每个亚家族含有1∽2个成员不等，基因的内含子数目在2∽5个之间，部分基因还存在可变剪接形式。进化分析显示，Lhca1和Lhca3亚族具有较早的起源，Lhca2和Lhca6存在于陆生生物中，Lhca4和Lhca5则只存在于高等植物中；在木薯和橡胶树中，Lhca1、Lhca2和Lhca4亚族都出现了基因的扩增。
- 邹智杨礼富安锋林位夫
- 关键词：全基因组进化分析
- 橡胶树“死皮”及其防控策略探讨被引量：19
- 2012年
- 天然橡胶是一种重要的工业原料,在2 000多种产胶植物中,巴西橡胶树(Hevea brasiliensisMuell.Arg.)以橡胶含量高、质量好、经济寿命长、易采收等独特优点成为天然橡胶的主要来源。作为典型的热带雨林乔木,全球适合橡胶树种植的土地资源极其有限,因而增加橡胶树的单位面积产量一直都是橡胶生产的核心任务。随着高产无性系的大力推广和乙烯利刺激割胶制度的广泛应用,橡胶单产目前已达到了前所未有的高度。然而,由于种种原因,橡胶树产排胶过程中会出现割线局部或全部不排胶的现象,即所谓的"死皮"。"死皮"给橡胶生产带来了巨大的损失(每年造成的干胶损失已超过15%),目前已成为制约橡胶树单产提高的主要因素。由于"死皮"成因的复杂性,至今对"死皮"的发生发展规律知之甚少。结合生产实践,讨论了不同"死皮"类型的主要特征和发生规律,并针对不同"死皮"类型、严重程度提出了一些切实可行的防控策略。
- 邹智杨礼富王真辉袁坤
- 关键词：巴西橡胶树死皮
- 4种大戟科植物PMK基因家族的全基因组鉴定与分析被引量：3
- 2013年
- 甲羟戊酸-5-磷酸激酶(PMK)是甲羟戊酸(MVA)途径中的关键酶,其在ATP和Mg2+等二价金属离子的存在下可逆地催化甲羟戊酸-5-磷酸(MVAP)磷酸化从而形成甲羟戊酸-5-焦磷酸(MVAPP)。基于已公布的基因组和EST数据,对蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树4种大戟科植物的PMK基因进行系统鉴定,分析其基因结构与进化特征。结果表明,蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树分别含有1、1、1和2个PMK基因,所有基因均含有9个内含子。根据同源性,PMK基因可分为2类,I类广泛分布于绿色植物和部分古细菌、真细菌和真菌中,II类则为动物所特有;虽然绝大多数绿色植物都含有PMK,但基因组范围内的搜索却未能在单细胞的绿藻中找到其同源基因;在大多基因组已测序的物种中,PMK主要以单拷贝的形式存在,其中包括蓖麻、麻疯树和木薯,但在橡胶树中基因出现了加倍现象,这与玉米和杨树类似。基因表达谱分析显示,在叶片、花、II/III期胚乳、V/VI期胚乳和种子等组织中,RcPMK在II/III期胚乳中的表达丰度较高,叶片、种子和花次之,而在V/VI期胚乳中的表达丰度最低。
- 邹智杨礼富安锋林位夫王真辉袁坤
- 关键词：全基因组
