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重庆市医学科技计划(2006)
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苯并蒽诱导金黄地鼠颊黏膜癌变的重要致病基因筛选
2010年
目的 利用基囚芯片和生物信息学分析技术探讨口腔黏膜癌变发生发展的不同阶段基因表达谱的改变,并筛选癌变的重要致病基因。方法用9,10-二甲基1,2苯并蒽(9,10-dimethylen-1,2-benzanthracene,DMBA)诱导建立金黄地鼠颊鳞状细胞痛模型,分别提取并纯化正常颊黏膜、癌前病变和鳞状细胞痛组织的总RNA并合成用Cy3荧光标记的cRNA,分别与含有41000条基因-表达序列标签(expressedsequence tags,EST)的Agilent大鼠全基因表达谱芯片杂交,以Ratio≥2和≤0.5为阈值确定癌变3个不同阶段的差异表达基因并分析相关生物信息,然后用GeneSpnng10.0软件行Venn图分析,筛选小在口腔颊黏膜癌变发生发展的3个不同阶段均持续表达异常的基因,用反转录聚合酶链反应(RT—PCR)对部分差异表达基凶行验证分析。结果金黄地鼠颊黏膜自正常黏膜到鳞状细胞癌的过程中,共有5255条差异表达基因,其中表达上调2896条,下调2359条。癌变的3个不同发展阶段均持续表达异常的基因共有22条,其中表达上调3条,下调19条。对上调基因EaG2和下调基因Ecg-2行RT—PCR验证结果与芯片结果相符。结论口腔黏膜癌变涉及众多基因表达的改变;癌变的不同阶段均持续表达异常的基因可能为癌变的重要致病基因,对以上基因的探讨将对研究口腔黏膜癌变发生发展的分子机制和靶向治疗具有重要作用。
张国栋
杨凯
梅杰
关键词:
口腔黏膜
鳞状细胞
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