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广东省科技计划工业攻关项目(2010A040302003)

作品数:2 被引量:5H指数:2
相关作者:张宝孙世强刘坤唐锴鹰马文丽更多>>
相关机构:南方医科大学华南理工大学更多>>
发文基金:广东省科技计划工业攻关项目国家自然科学基金更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇医药卫生

主题

  • 1篇生物学
  • 1篇周期
  • 1篇转录
  • 1篇转录因子
  • 1篇细胞
  • 1篇细胞周期
  • 1篇流行病
  • 1篇流行病学
  • 1篇流行病学分析
  • 1篇基因
  • 1篇基因表达
  • 1篇基因表达谱
  • 1篇基因表达谱分...
  • 1篇基因特征
  • 1篇计算生物学
  • 1篇分离株
  • 1篇肝细胞
  • 1篇VP1
  • 1篇EV71
  • 1篇表达谱

机构

  • 2篇南方医科大学
  • 1篇华南理工大学

作者

  • 2篇张宝
  • 1篇郑文岭
  • 1篇吴清华
  • 1篇陈虎
  • 1篇李凌
  • 1篇万成松
  • 1篇冯春琼
  • 1篇赵卫
  • 1篇马文丽
  • 1篇唐锴鹰
  • 1篇黄克勇
  • 1篇刘坤
  • 1篇孙世强

传媒

  • 1篇现代预防医学
  • 1篇中华肿瘤防治...

年份

  • 1篇2014
  • 1篇2012
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
肝细胞癌基因表达谱分析被引量:3
2012年
目的:通过分析肝细胞癌(HCC)基因表达谱改变来探讨HCC发病机制。方法:从GEO数据库中下载HCC基因表达数据GSE14215和GSE29217,采用Genespring 11.0软件分析差异表达基因,运用统合分析(meta-analysis)方法确定共同差异表达基因,利用DAVID、KEGG、String和FABLE等生物信息学软件确定相关的生物学过程、分子功能、相互作用通路等。结果:HCC组织与正常肝组织相比,共同下调、上调的差异表达基因分别是281和227个,其中作为转录因子36个;与文献报道的HCC相关基因一致的有181个。差异表达基因主要与细胞周期调控、代谢调节、药物代谢酶系、DNA的损伤复制、p53和过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路(PPAR)等信号通路有关。结论:HCC基因表达谱数据分析表明,细胞周期紊乱主要发生在S、M期;转录因子FOXM1/HNF3高表达与HCC的细胞周期紊乱密切相关。
张宝唐锴鹰孙世强刘坤冯春琼吴清华陈虎郑文岭马文丽
关键词:肝细胞基因表达谱计算生物学细胞周期转录因子
1966-2011年全球肠道病毒71型部分分离株的基因特征及流行病学分析被引量:2
2014年
目的 分析人类肠道病毒71型(EV71)基因特征及流行病学信息。方法 用生物信息学软件对来自13个国家、中国的17省、直辖市不同时间内分离的270株EV71病毒VP1区基因序列进行分析,计算不同毒株的核苷酸差异率以及基因型/亚型内部、之间的同源性,构建系统发生树,分析流行病学信息。结果 270株病毒可分为3个基因型( A、B、C型),B型和C型又各可分为5个亚型;其中A型只有3株,B型和C型占了98.9%。不同毒株的核苷酸差异率为7.1%~25.9%,不同基因型之间的核苷酸差异率为23.0%~25.9%。同时从发生树中发现一些区别于B型和C型的“孤儿株”。结论 同一地区可以出现某种基因型/亚型流行很长时间,同一时间内可以出现不同的基因型/亚型在某地区流行,具有明显的时间和地域流行特点。“孤儿株”的发现为EV71的不断进化以及具有基因多态性提供了证据。
黄克勇李凌赵卫万成松张宝
关键词:VP1基因特征流行病学分析
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