广东省教育厅优秀人才培养基金(LYM08086)
- 作品数：2 被引量：5H指数：1
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- 相关机构：复旦大学深圳大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省教育厅优秀人才培养基金更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 高分子链坍塌转变动力学过程的动态蒙特卡罗模拟被引量：5
- 2009年
- 基于键长涨落格子模型和动态蒙特卡罗模拟方法,引入疏水相互作用,对均聚高分子链坍塌转变动力学过程进行了模拟研究.模拟发现,其坍塌时间呈高斯分布,而平均坍塌时间随淬火深度的变化类似于蛋白质折叠,但难以发现局部最小;另外,平均坍塌时间随链长呈指数形式变化.在其坍塌动力学过程中,高分子链构象先由橄榄球状演变为项链状,进而演变为香肠状,最后形成近球状的熔融球;基于团簇数目、团簇大小和非球面参数等参量,对前人提出的动力学过程四阶段划分进行了更为清晰的界定.
- 陈彦涛丁建东
- 关键词：动力学过程
- 非天然相互作用对均聚多肽链螺旋形成动力学过程的影响的计算机模拟研究被引量：1
- 2010年
- 以螺旋结构的形成过程为研究对象,基于粗粒化的格子模型和动态蒙特卡罗模拟方法,初步探讨了非天然氢键相互作用对均聚多肽链螺旋折叠动力学过程的影响.研究发现,非天然氢键的引入虽然延缓了其热力学转变的发生,但也从整体上降低了折叠动力学过程的能垒,在某一特定温度之下,反而可以提高折叠速率.对其折叠路径分布的分析表明,非天然氢键可以减少慢速折叠路径的发生,而后者是导致折叠时间增加的主要因素.另一方面,比较特定温度下多肽链链构象及螺旋片断随时间的演化进程,发现非天然氢键在一定程度上影响了天然氢键的形成以及天然态构象的稳定存在,同时也加快了其部分解折叠过程.这说明,非天然相互作用的存在有利于蛋白质构象的快速动态调整,从而行使其相应的生物功能.
- 陈彦涛丁建东
- 关键词：动力学过程
