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丛枝病对白花泡桐环状RNA表达谱变化的影响被引量：5: 2018年; 为了进一步探究泡桐丛枝病发生的分子机制,以白花泡桐健康苗及病苗为试验材料,参考白花泡桐基因组序列,利用高通量测序技术研究白花泡桐circRNAs在丛枝病发病过程中的表达情况。通过进一步分析,本研究共鉴定得到1 009个circRNAs,其中差异表达的为50个。对差异circRNAs的host gene进行GO功能分类和KEGG pathway富集分析。其中,GO功能分类结果表明,这些host gene主要涉及叶绿体、蛋白结合、细胞质方面的功能。KEGG代谢通路分析表明他们参与了Plant-pathogen interaction、Glycine,serine and threonine metabolism等代谢通路。; 李冰冰王哲曹亚兵林丹范国强; 关键词：白花泡桐丛枝病

悬铃木SSR反应体系建立及引物筛选被引量：4: 2012年; 以三球悬铃木组培苗为试验材料,对影响SSR-PCR扩增效果的退火温度、dNTP、引物浓度、Taq酶量及悬铃木DNA等因素的筛选,建立适宜的悬铃木SSR-PCR分子标记反应体系。结果表明,在20μL-1体积中,50℃退火温度、4 ng.μL-1模板DNA、0.2 mmol.L-1 dNTP、0.05 U.μL-1 Taq酶量和0.6μmol.L-1引物浓度是悬铃木的最适SSR反应体系。此外,利用该体系筛选出了54对适合悬铃木SSR扩增的引物。; 刘荣宁赵晓改赵振利范国强; 关键词：悬铃木 SSR-PCR 引物筛选

利福平对毛泡桐长链非编码RNA表达谱变化的影响被引量：1: 2017年; 为阐明lncRNAs对泡桐生长发育的调控作用,以利福平处理前后毛泡桐健康苗为试验材料,利用高通量测序技术研究利福平处理前后毛泡桐长链非编码RNA及其靶基因的表达变化情况。共鉴定出129个差异表达的lncRNAs,其中有83个差异lncRNAs对应289个靶基因,对这些靶基因进行GO功能分类,发现这些差异的靶基因共参与9个GO分类,其中细胞过程、代谢过程及涉及单有机体的靶基因数量最多。KEGG代谢通路分析发现,这些差异靶基因参与了植物激素信号转导、次生代谢生物合成等代谢通路。并采用qRT-PCR技术验证了随机挑选的6个差异表达长链非编码RNA及靶基因,结果与高通量测序数据一致。; 李永生李冰冰曹亚兵王哲董焱鹏邓敏捷赵振利范国强; 关键词：毛泡桐长链非编码RNA

盐胁迫对南方泡桐基因表达的影响被引量：2: 2017年; 为阐明泡桐多倍体的耐盐分子机制,以南方泡桐二倍体及对应的四倍体为试验材料,以白花泡桐基因组为参考序列,利用RNA-Seq测序技术,研究了盐处理前后南方泡桐四倍体和对应二倍体的基因表达变化。通过比对分析,共鉴定出与盐胁迫相关的差异表达基因2 940个。对这些差异基因进行GO功能分类,结果显示差异基因共参与了39个分类,集中在细胞、结合、催化等分类功能区的数量最多。KEGG代谢通路分析发现,这些差异表达基因主要参与了Plant hormone signal transduction,Carbon metabolism,Biosynthesis of amino acid等,其中编码MYB、WRKY、bZIP、ATPase等的基因差异表达显著。表明这些基因可能是潜在的盐胁迫响应基因。采用qRTPCR技术验证了随机挑选的9个差异表达基因,结果与转录组测序数据趋势一致。; 李冰冰赵振利邓敏捷曹亚兵董焱鹏范国强; 关键词：盐胁迫差异表达基因转录组

悬铃木AFLP反应体系优化及引物筛选被引量：3: 2011年; 以三球悬铃木为试验材料,通过对影响AFLP反应体系的各主要因素的研究,建立了悬铃木AFLP分析技术的体系.结果表明,悬铃木AFLP最佳酶切体系(20μL)为模板DNA1 000ng,PstI和MseI各为3 U,在37℃下双酶切3 h;在20μL最佳连接体系中,15μL酶切产物为3U,T4连接酶,0.25μmol·L-1PstI接头,2.5μmol·L-1MseI接头,1μL 10×T4buffer,在22℃下连接12 h;在20μL最佳预扩反应体系中稀释15倍的连接产物5μL,2.0 mmol·L-1Mg2+,2 UTaq酶,200μmol·L-1dNTP,0.5μmol·L-1PstI和M seI引物(P+AGA/M+ATC);在20μL最佳选择性扩增反应体系中5μL稀释15倍的预扩增产物,2.0 mmol·L-1的Mg2+,2 UTaq酶,200μmol·L-1dNTP,0.5μmol·L-1PstI和M seI引物(P+AGA/M+ATC).最后,利用上面的体系筛选出了92对适宜于悬铃木AFLP分析的引物.; 刘荣宁谢一鸣赵改丽范国强; 关键词：AFLP 引物筛选

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国家公益性行业科研专项(201004002)