国家高技术研究发展计划(2007AA10Z100) 作品数:8 被引量:119 H指数:6 相关作者: 胡建斌 李建吾 梁芳芳 刘颖 袁鸣 更多>> 相关机构: 河南农业大学 上海市农业科学院 扬州大学 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 博士科研启动基金 河南省农业科技成果转化项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
不同代次猪胎儿成纤维细胞CLK1基因差异表达分析 引言CLKs(CDC-2-like kinase homologs)激酶家族存在于包括果蝇、小鼠、人类等许多生物中,是进化上保守的双特异性激酶。而CLK1(CDC-2-like kinase 1)是CLKs激酶家族的一员... 颉孝贤 贺艳芬 李加琪关键词:胎儿成纤维细胞 实时荧光定量 文献传递 猪E-FABP基因在不同猪种组织的差异表达 引言脂肪酸结合蛋白(Fatty acid-binding proteins,FABPs)是低分子(14~15 kDa)细胞溶质蛋白,能够特异地与脂肪酸结合,是细胞内运输脂肪酸的重要蛋白。目前,在哺乳动物中发现了9种不同类... 钟玉宜 杨莉 李加琪 颉孝贤关键词:十二指肠 背最长肌 背膘 文献传递 PAGE凝胶制备方法和银染方法的改进 被引量:18 2009年 PAGE凝胶分析技术已广泛运用于小分子量PCR产物的分离,但因操作环节多、耗时长,不利于大规模分子标记分析工作的开展。对PAGE凝胶的制备和银染方法作些改进,省去常规凝胶制备中亲和硅烷/剥离硅烷处理过程,以及常规银染过程中的固定和定影两步骤。与常规方法相比,该方法操作简便、耗时短、带谱的分辨率高,可代替常规方法用于SSR等标记的PCR产物的分离。 胡建斌 李静 袁鸣 胡深 李建吾关键词:聚丙烯酰胺凝胶 银染方法 SSR标记 黄瓜cpSSR引物的多态性与通用性 被引量:1 2010年 从黄瓜叶绿体基因纽序列中设计15对以A或T为重复单元的微卫星引物,其中12对处于基因组非编码区,3对位于基因编码区。这15对引物在21份黄瓜材料中均有扩增产物,但只有非编码区的微卫星表现出位点多态性。每对引物可检测1~3个等位基因,平均2.0个,引物的多样性值(polymorphic information content PIC)从0至0.484,平均值0.202。15对引物在甜瓜和南瓜中均能通用,13对可在西瓜中通用。这些叶绿体引物可用于黄瓜及其近缘种的叶绿体遗传研究。 梁芳芳 李琼 胡建斌 李建吾关键词:黄瓜 多态性 鸡胚不同发育阶段Twist2基因表达谱分析 引言Twist基因是在进化过程中的一个保守转录因子,它属于螺-环-螺(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子家族,可调节胚胎发育过程中的细胞重建,并赋予细胞迁移的能力。研究发现Twist基因在果... 邢晋祎 姜运良关键词:鸡胚 表达谱 文献传递 黄瓜叶绿体基因组全序列微卫星分布特征与标记开发 被引量:11 2009年 对黄瓜叶绿体基因组(chloroplast genomic DNA,cpDNA)全序列中微卫星(chloroplast simple sequence repeat,cpSSR)的分布特征进行了全面分析。结果发现,cpSSR主要分布在25~40kb和100~130kb两个区域,主要以完全重复和间隔重复为主。单碱基重复最多,占总数的79.3%,二碱基重复占10.1%,三碱基和三碱基以上重复仅占10.6%。单碱基重复主要以(A)n和(T)n为主,二者共占总数的78.8%,二碱基重复主要是(AT)n,占总数的9.3%。在重复次数分布上,完全重复的(A)n和(T)n均以最低重复次数为主,而间隔重复的(A)n和(T)n以14次或15次为多。设计了6对引物,对7份黄瓜自交系cpDNA进行扩增。结果发现,6对引物均有扩增产物,每对引物平均能检测到2.2个等位基因。几乎所有引物都能在甜瓜、西瓜、葫芦和栝楼中通用,5对引物在1~4种远缘种中有扩增产物。上述结果表明,从黄瓜cpDNA中发掘cpSSR标记是一条可行的途径。 胡建斌 李建吾 梁芳芳 刘颖关键词:黄瓜 叶绿体基因组 微卫星 猪CAT基因克隆及在不同代次猪胎儿成纤维细胞中的表达规律 引言过氧化氢酶(catalase,CAT)广泛存在于动物、植物和微生物体内,它以HO为底物,通过催化一对电子的转移而最终将其分解为水和氧气,是体内清除自由基的重要酶之一。测定CAT基因在不同代次猪胎儿成纤维细 冯小曼 侯海军 李加琪关键词:胎儿成纤维细胞 基因克隆 生物信息学分析 基因表达 文献传递 黄瓜cpSSR-PCR反应体系优化及应用 被引量:1 2009年 叶绿体微卫星(chloroplast microsatellite,cpSSR)是近几年发展起来的新型高效分子标记,在植物系统发育和基因漂移研究中有广泛应用。在前期开发黄瓜cpSSR引物的研究基础上,本文研究了Taq酶量、MgCl2浓度、dNTPs浓度、模板DNA质量和浓度、循环次数等参数对cpSSR-PCR扩增效果的影响,获得优化的反应体系,即15μL体积包括:1×Taq酶缓冲液,0.5UTaq聚合酶,0.2μmol/L引物,0.2mmol/LdNTPs,1.5mmol/LMgCl2,约10ng模板DNA,循环25次。采用该优化体系,以已开发的黄瓜cpSSR引物,对12份黄瓜材料进行了重复性PCR扩增。结果发现国外种质中存在3种单倍型,而在国内种质中只检测到2种单倍型,说明在本研究所用的材料中,国外种质叶绿体遗传差异明显大于国内栽培种。此结果说明优化的cpSSR反应体系具有稳定性和可靠性。 胡建斌 梁芳芳 李建吾 袁鸣 董小结 侯卫真关键词:黄瓜 CPSSR 单倍型 荚膜红细菌SQR基因的克隆及重组质粒的构建 引言家畜肠道排出物中会有HS、CH、NH、短链脂肪酸,及一些小分子量的硫化物散发出令人不快的气味,如果能人为的除去肠道中硫化物残留,就会避免或减轻这种难闻气味的产生,改善家畜生活环境和周围生态 贺艳芬 汪亮亮 颉孝贤 李加琪关键词:荚膜红细菌 SQ 克隆 重组质粒 文献传递 黄瓜基因组EST-SSRs的分布规律及EST-SSR标记开发 被引量:21 2008年 从NCBI网站下载黄瓜EST序列6 344条及本课题组对黄瓜叶片cDNA文库测序研究所得的EST 163条,在除去载体、polyA/T等序列后得到6 129条无冗余EST序列,全长为2.98×106bp.采用网络软件SSRIT从这些序列中搜索到784个SSR,分布于673条EST中,出现频率为12.79%,平均分布距离为3.80 kb;单、二和三核苷酸重复是主导类型,分别占EST-SSRs总数的32.91%、28.19%和29.34%;A/T、AG/CT和AAG/CTT分别是单、二和三核苷酸的优势重复基元,分别占EST-SSRs总数的32.40%、20.66%和14.41%.经现已报道的评价方法分析表明,这些EST-SSRs具有较好的多态性和可用性.设计了30对EST-SSR引物对22份黄瓜材料进行PCR检测,18对引物检测到多态性.根据PCR结果,这些材料被聚为三类,聚类结果与材料本身特性一致.结果说明通过黄瓜EST数据库发掘SSR标记是一条可行的途径. 胡建斌 李建吾关键词:黄瓜 EST-SSR 多态性