国家自然科学基金(30600403)
- 作品数:4 被引量:25H指数:3
- 相关作者:尤民生杨广魏辉关雄谢苗更多>>
- 相关机构:福建农林大学福建省农业科学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金福建省自然科学基金国家科技部农业科技成果转化资金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 基于质谱和生物信息学分析的小菜蛾蛋白质鉴定被引量:5
- 2009年
- 本研究以非模式昆虫小菜蛾Plutella xylostella为材料,对比2,3,4龄幼虫的蛋白质组双向电泳图谱,得到24个蛋白质差异点,从中选取了编号为1111的差异表达蛋白质点进行质谱鉴定和生物信息学分析。采用胶内酶解的多肽进行MALDI-TOF/TOF分析,获得该点的肽质量指纹图谱(PMF)及串联质谱(MS/MS)图谱。将获得的PMF分别用MASCOT和ProFound等常用软件在NCBInr的Metazoa蛋白质数据库进行搜索,匹配结果不理想。进一步用PMF+MS/MS谱图搜索NCBInr的Metazoa蛋白质数据库,以及小菜蛾EST数据库。在NCBInr库中匹配结果为拟暗果蝇Drosophila pseudoobscura中的一种假定蛋白GA18218-PA,而用EST库搜索的结果为家蚕Bombyx mori的ATP合酶的亚基。为验证搜索结果,将该蛋白质点进行磺基异硫氰酸苯酯(SPITC)化学衍生后de novo测序,最后确认该点可能为ATP合酶的一个亚基。最后着重讨论了蛋白质的质谱鉴定与生物信息学分析的联合使用,希望据此选择出最适合于非模式昆虫蛋白质组学鉴定的方法。
- 谢苗成娟尤民生杨广蔡敬轩
- 关键词:小菜蛾蛋白质肽质量指纹图谱串联质谱生物信息学
- 微卫星DNA标记技术及其在昆虫学上的应用被引量:5
- 2006年
- 微卫星DNA标记作为一种多态性和稳定性高、重复性好、呈共显性的分子遗传标记技术,目前已被广泛应用于昆虫学的研究中。本文介绍了微卫星DNA标记的基本原理和特点,并综述了近年来该技术在昆虫种群遗传结构及分化、生物学特性与习性、遗传图谱的构建、基因定位以及系统发生等领域中的应用。
- 王定锋陈小龙尤民生
- 关键词:微卫星DNA标记简单序列重复分子遗传标记多态性昆虫学
- 挥发性有机化合物(VOCs)采样方法的研究进展被引量:3
- 2008年
- 对近年来国内外挥发性有机化合物(VOCs)采集方法的研究进展进行了综合和概括。对VOCs几种主要的采样方法包括顶空收集法、液液萃取法、超临界流体萃取、吸附剂收集法、吹扫捕集法、固相微萃取等技术进行了阐述和比较,提出应根据实验材料的特性选择合适的采样方法,旨在为应用VOCs的采集方法及相关研究提供参考和借鉴。
- 田厚军杨广
- 关键词:采样方法挥发性有机化合物