达能营养中心膳食营养研究与宣教基金(06HT25) 作品数:6 被引量:36 H指数:4 相关作者: 裴晓方 王嵬 丁晓贝 黄玮 李永儒 更多>> 相关机构: 四川大学 江苏省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 达能营养中心膳食营养研究与宣教基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
拟杆菌属实时荧光定量PCR的建立 被引量:4 2010年 [目的]建立拟杆菌属TaqMan实时荧光定量PCR检测方法,为拟杆菌属的快速检测以及相关研究提供有用的工具。[方法]从GenBank中下载拟杆菌属细菌16SrRNA基因序列并进行同源性比较,选择保守区段进行引物和探针的设计。对反应条件进行优化后,通过重组质粒建立标准曲线,并对建立的方法进行灵敏度、特异性、重复性评价。[结果]所建立的实时荧光定量PCR直线回归方程的决定系数R为0.9957,检测灵敏度达到103cfu/ml,检测时间不超过2h,批内与批间5次重复性试验的变异系数CV均在1.19%~2.21%之间。[结论]所建立的拟杆菌属Taq-Man实时荧光PCR具有快速、定量、简便、准确的特点,为临床拟杆菌感染的快速诊断、肠道拟杆菌属的快速计数提供了有力的技术支持。 张薇薇 杨晶艳 王嵬 黄玮 杨蕊嘉 裴晓方关键词:拟杆菌属 实时荧光PCR 重组质粒 成都地区肥胖人群UCP2基因多态性研究及其与肠道菌群关系的初探 被引量:4 2009年 目的研究成都地区单纯性肥胖和正常体质量成人解偶联蛋白2基因(UCP2)Ala55Val多态性,初步探讨UCP2基因Ala55Val不同基因型与肠道菌群关系。方法采用PCR-RFLP检测86例成都地区成人(单纯性肥胖组43例,正常体质量组43例)的UCP2基因ALa55Val多态性,并分别比较不同基因型间6种肠道菌群数量的差异。结果单纯性肥胖组和正常体质量组均存在UCP2基因Ala/Ala、Ala/Val、Val/Val多态,两者表型分布差异有统计学意义(χ2=11.97,P<0.05);单纯性肥胖组UCP2等位基因突变频率高于正常体质量组,差异有统计学意义(χ2=10.06,P<0.05);单纯性肥胖组、正常体质量组和研究总体中不同基因型人群的6种肠道菌群数量差异无统计学意义(P>0.05)。结论UCP2基因ALa55Val变异可能是成都地区人群单纯性肥胖的危险因素,但该基因ALa55Val变异与肥胖的关联可能与肠道菌群数量改变无关。 左浩江 张薇薇 谢志梅 李永儒 王嵬 丁晓贝 裴晓方关键词:单纯性肥胖 基因多态性 肠道菌群 PPAR-γ2及UCP2基因多态性与成都地区单纯性肥胖相关性初探 被引量:1 2009年 [目的]初步研究肥胖候选基因过氧化物酶增殖激活物受体-γ2(PPAR-γ2)基因Plo12Ala的变异以及解偶联蛋白2(UCP2)基因Ala55Val的变异与成都地区人群单纯性肥胖的关系,并考察两者是否存在协同作用,从而为成都地区单纯性肥胖的研究与防治提供参考。[方法]将研究对象分为单纯性肥胖组和对照组。用聚合酶链反应—限制性片断长度多态性的方法(PCR-RFLP)检测两组研究对象的PPAR-γ2、UCP2基因的变异情况,分析两个基因的变异以及联合变异在两组间差异是否具有统计学意义。[结果]UCP2基因的变异在两组中的差异有统计学意义(P﹤0.05);而PPAR-γ2基因变异以及两者的联合变异在两组中的差异无统计学意义(P﹥0.05)。[结论]UCP2基因Ala55Val变异可能与成都地区单纯性肥胖相关,而PPAR-γ2的Plo12Ala基因的变异不是成都地区人群肥胖的危险因素,且两者不具有协同作用。 王嵬 张薇薇 谢志梅 李永儒 裴晓方关键词:解偶联蛋白2 单纯性肥胖 拟杆菌作为粪便污染指示微生物的初探 被引量:3 2011年 目的 通过外环境中拟杆菌属菌量与大肠菌群存活菌量之间的相关性分析,探讨拟杆菌作为粪便污染指示微生物,并采用实时荧光定量PCR实现快速检测的可能性.方法 用大肠菌群最大或然数(most probable number,MPN)计数法和实时荧光定量PCR法分别定时检测模拟水样中大肠菌群的存活菌量及拟杆菌属菌量,探讨二者的污染检出时限和相关性.同时分别检测在3个时间点采集4个位点的12份河流水样,比较二者的检出情况.结果 MPN计数法检测大肠菌群需要72 h,而实时荧光定量PCR法检测拟杆菌不超过3 h;室内外模拟水样大肠菌群污染检出时限分别为>40 d和9 d,而拟杆菌的污染检出时限分别为13 d和5 d;室外模拟水样拟杆菌属菌量(从第1天的8.3×106拷贝/ml下降到第5天的小于检出限104拷贝/ml)和大肠菌群存活菌量(从第1天的大于4.3×106MPN/100 ml下降到第5天的2.4×103 MPN/100 ml)之间呈正相关;12份河水水样两种方法检出均为阳性,符合率为100%,均说明二者对粪便污染的检测结果具有很好的一致性.结论 拟杆菌有可能作为粪便污染的指示微生物,并通过实时荧光定量PCR实现快速检测. 杨晶艳 陈智瑾 丁晓贝 黄玮 杨蕊嘉 裴晓方关键词:拟杆菌属 大肠菌群 细菌学技术 环境监测 肠道微生物与肥胖关系研究进展 被引量:9 2008年 WHO建议以BMI作为肥胖判定的标准.即将BMI(Body mass index体质指数)25kg/m^2定义为超重.30kg/m^2则为肥胖。肥胖使糖尿病、高血压、动脉粥样硬化的危险度大大增加,肥胖成为美国继烟草后的第2大死因.在美国,1/3的成人超重或者肥胖,而全世界超重/肥胖人群已超过5亿.肥胖成为日益严峻的全球性公共卫生问题。目前,关于肥胖的病因研究进展迅速,为人们解释肥胖现象提供了可能。多数学者认为,肥胖是多因素作用的结果^[2],环境、营养、个人行为、 陈恒 叶盛 左延文 裴晓方关键词:肥胖 肠道微生物 肠道菌群与粪便性状关系初探 被引量:15 2010年 [目的]初步探讨肠道菌群与粪便性状之间的关系。[方法]取受试者的粪便,将其分级后培养,计数粪便中大肠杆菌、肠球菌、拟杆菌、产气荚膜梭菌、双歧杆菌和乳杆菌的菌落数,比较不同级别的粪便中各细菌数量及所占比例有无统计学差异。[结果]I级与III级、II级与III级粪便的所有指标均无统计学差异(P﹥0.05);I级与II级比较,双歧杆菌、6种菌的总菌落数、厌氧菌、益生菌、硬壁菌门/总菌数、硬壁菌门/非硬壁菌门菌、产气荚膜梭菌/总菌落、拟杆菌/总菌落均有统计学差异(P﹤0.05)。[结论]肠道细菌与粪便性状之间存在一定关系,粪便性状在一定程度上可以反映人体肠道菌群数量的多少。 李永儒 丁晓贝 左浩江 王嵬 黄玮 裴晓方关键词:粪便性状 肠道细菌