国家现代农业产业技术体系建设项目(nycytx-4)
- 作品数:1 被引量:5H指数:1
- 相关作者:李赟王娜蔡玉勇王崇明更多>>
- 相关机构:中国海洋大学中国水产科学研究院黄海水产研究所更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 应用DGGE技术分析扇贝养殖海区真核浮游生物种群多样性被引量:5
- 2010年
- 为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度,本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18S rDNA V1~V3区的高变区序列,筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度,结果表明,扩增序列长560 bp,DGGE分析可将不同藻种分离开。随后对青岛沙子口扇贝养殖海区9个月份真核浮游生物多样性进行了DGGE分析,结果从9个月份2 m深的海水中总共扩增出38条谱带,其中共有谱带3条,占总数的7.69%,不同月份的特征性谱带11个,占总谱带数的28.2%。不同月份水样中的谱带数显著不同,香农多样性指数为0.4632。相似性分析表明,2009年3和4月养殖海区真核微生物种类相似性最高,为89.7%。基于不同月份水样微生物种类多样性进行UPGMA聚类分析,结果表明,2008年5,6,8月和2009年1,2,3,4月分别聚为一支,显示取样时间相近的月份微生物种类相似度最高。
- 王娜蔡玉勇李赟王崇明崔红
- 关键词:PCR-DGGERDNA序列