浙江省科技攻关计划(2006-2009)
- 作品数：1 被引量：11H指数：1
- 相关作者：魏建民李元李鹏汪阳东更多>>
- 相关机构：中国林业科学研究院内蒙古农业大学更多>>
- 发文基金：浙江省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 油桐种子FADX基因的克隆和序列分析被引量：11
- 2008年
- [目的]克隆油桐种子FADX基因全长cDNA。对该基因作生物信息学分析,为进一步研究该基因的功能提供参考。[方法]以未成熟的油桐种子为材料,利用改良TRIzoL法提取总RNA,并根据GenBank中已经登录的α桐酸合成酶基因FADX的序列,设计特异性引物;采用RTPCR方法,克隆得到FADX基因全长cDNA,应用Antheprot软件和InterProScan对该基因进行了生物信息学分析。[结果]该序列5'端和3'端非编码区序列长度分别为13、47 bp,含有1个开放阅读框(14～1 174 bp),编码386个氨基酸,含有典型的脂肪酸脱氢酶结构域;相对分子量是44 343.0,理论等电点为8.33。二级结构预测表明,该蛋白α螺旋含量占29%,β折叠占32%,转角占6%。[结论]该蛋白属于脂肪酸脱氢酶。
- 李元汪阳东李鹏魏建民
- 关键词：油桐克隆生物信息学分析
