中国科学院西部之光基金(Y12S221401)
- 作品数：1 被引量：9H指数：1
- 相关作者：艾先涛李晓波李雪源肖向文郑巨云更多>>
- 相关机构：石河子大学新疆农业科学院中国科学院新疆理化技术研究所更多>>
- 发文基金：中国科学院西部之光基金新疆生产建设兵团博士基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 不同色彩矮牵牛DFR基因的克隆与生物信息学分析被引量：9
- 2013年
- 二氢黄酮醇4-还原酶基因(DFR)是花色素合成途径中的一个关键基因。以新疆种植的白、红和蓝色矮牵牛为试验材料,通过同源克隆的方法从花中克隆到3个完整的DFR基因的全长编码序列(CDS),与已知的矮牵牛DFR基因(GenBank登录号:X15537)序列的相似性分别为97.79%、96.59%和97.99%,分别命名为PhDFR1,PhDFR2和PhDFR3;3个基因编码380个氨基酸,同已知矮牵牛DFR基因编码的蛋白(GenBank登录号:CAA33544)的同源性分别是95.53%、94.21%和95.79%;生物信息学分析表明,3个蛋白均具有NADB-Rossmann家族中高度保守的NADPH结合位点、底物特异性结合位点。3个矮牵牛品种DFR都不具有信号肽,为亲水蛋白,定位于细胞质的可能性最高;均具有两个跨膜结构,α-螺旋和β-折叠是3个DFR的主要二级结构元件,并且形成了β-α-β-α-β的Rossmann折叠,整本上呈对称分布。利用同源建模分析3个DFR蛋白与已知葡萄的DFR晶体结构有很高的相似性。系统进化树分析表明,PhDFR1、PhDFR2、PhDFR3与已知矮牵牛DFR蛋白亲缘关系最近。
- 朱奇朗李晓波肖向文李雪源黄先忠郑巨云艾先涛
- 关键词：矮牵牛同源克隆生物信息学分析
